4 октября 1942 года при очередной поездке на передовые позиции Иван Степанович был тяжело ранен, началась га­зовая гангрена и пришлось ампутировать ногу. Он мужест­венно перенес все страдания. Искусством и заботой военных врачей он был возвращен к жизни и постепенно поправлял­ся. Фактически он стал инвалидом, но железная воля и без­граничная преданность Родине и флоту помогли Ивану Сте­пановичу еще долго и плодотворно служить Отечеству.

Ограничимся лишь кратким перечислением ответствен­ных задач и поручений, которые выполнял Иван Степанович после относительного выздоровления и возвращения в Москву из Тбилиси в мае 1943 года.

  В 1944—1945 годах И. С. Исаков — член правительствен­ной комиссии по подготовке условий капитуляции Германии. В 1944-м ему присвоено звание адмирала флота. В феврале 1946 года он вновь назначен начальником Главного штаба— заместителем главкома Военно-Морских Сил, с февраля 1947-го — заместителем главкома Военно-Морских Сил по изучению и использованию опыта Великой Отечественной войны, с марта 1950 по февраль 1956 года — в отставке. В 1954 году по решению правительства И. С. Исаков был назначен заместителем министра Морского флота СССР. С 1958 года он — генеральный инспектор Группы генераль­ных инспекторов Министерства обороны СССР.

С мая 1947 по ноябрь 1954 года И. С. Исаков — ответ­ственный редактор, а затем член редколлегии по подготовке к изданию «Морского атласа».

   В 1947 году И. С. Исакову было присвоено звание про­фессора, в мае 1958-го по совокупности научных работ в об­ласти океанологии и географии, за участие в создании Атла­са мира и руководство созданием Морского атласа он избран членом-корреспондентом Академии наук СССР, а в марте 1967 года — почетным членом Академии наук Армянской ССР. 15 сентября 1958 года Мексиканская национальная академия военных исследований вручила И. С. Исакову по­четный диплом члена академии.

   В 1947 году Иван Степанович избирается депутатом Вер­ховного Совета РСФСР.

За большие заслуги перед Родиной И. С. Исаков был на­гражден шестью орденами Ленина, тремя орденами Красно­го Знамени, орденом Красной Звезды, орденом Отечествен­ной войны I степени, двумя орденами Ушакова I степени, медалями Советского Союза и тремя иностранными ордена­ми. В марте 1955 года И. С. Исакову было присвоено звание Адмирала Флота Советского Союза, в мае 1965-го — звание Героя Советского Союза.

В октябре 1967 года И. С. Исаков скончался, оставив бо­гатейшее научное наследие.

Из библиографии трудов И. С. Исакова читатель может получить представление о широком диапазоне научных ис­следований по многим проблемам.

   Труды И. С. Исакова посвящены злободневным темам и сыграли большую роль в жизни советского Военно-Морского Флота. И. С. Исаков способствовал улучшению научно-ис­следовательской работы в области изучения опыта второй мировой войны, разработки важных для флота в новых ус­ловиях теоретических положений, изучения Мирового океа­на и подготовки высококвалифицированных кадров для флота

   И. С. Исаков всегда проявлял исключительную работо­способность и добросовестность и даже в самые острые пе­риоды тяжелой болезни напряженно работал. Он старался быть полезным товарищам, друзьям, всем советским людям.

Одна из характерных черт научной деятельности И. С. Исакова заключалась в том, что он, как истинный ученый, проявлял постоянную неудовлетворенность уровнем своих знаний, внимательно следил за новым в современной науке.

Иван Степанович был наделен замечательными человече­скими чертами. Об этом убедительно говорят близко знав­шие его товарищи по службе. Он обладал редкой чуткостью, в отношениях со своими сослуживцами и друзьями всегда проявлял большой такт. Можно только удивляться, как он умел находить время для того, чтобы лично отвечать на ог­ромный поток писем своих корреспондентов: адмиралов, ге­нералов, офицеров, аспирантов, диссертантов, ученых, писа­телей, журналистов, работников искусств, друзей и това­рищей.

   В статье «Талантливый флотоводец» Маршал Советского Союза И. X. Баграмяи тепло характеризует флотоводческую деятельность своего большого друга — И. С. Исакова, на­значенного в апреле 1942 года заместителем главнокоманду­ющего и членом Военного совета Северо-Кавказского направ­ления: «Организаторский талант Ивана Степановича в ту пору был направлен на объединение усилий сухопутных войск и военно-морских сил, действующих в Севастополе, на Керченском полуострове и на Кавказском побережье» .

Хочется отметить еще один штрих из жизни Исакова.

   Несмотря на большую занятость и тяжелую болезнь, он всегда старался быть полезным и своим землякам в Арме­нии. Его обширная переписка с рабочими и колхозниками, пионерами и комсомольцами, учеными, партийными и совет­скими работниками Армении, его рассказы о подвигах ар­мян-моряков в годы Великой Отечественной войны в значи­тельной степени способствовали патриотическому воспита­нию молодежи в духе любви к армии и флоту.